Սնկային վարակները հաճախ առաջանում են մարմնում բնականաբար առկա միկրոօրգանիզմների պարզ անհավասարակշռությունից:

Այն իրականում գաղութացված է բազմազան սնկերի և բակտերիաների կողմից, որոնք ժամանակի մեծ մասում անվնաս են և նույնիսկ էական են մարմնի պատշաճ գործունեության համար:

Այնուամենայնիվ, կարող է պատահել, որ այս սնկերի մի մասը բազմանա և դառնա պաթոգեն, կամ որ «արտաքին» սնկերը, օրինակ ՝ կենդանու կողմից փոխանցված, վարակ առաջացնեն: Ընդհանուր առմամբ սնկերի 200-400 տեսակ կարող է մարդկանց մոտ հիվանդություն առաջացնել⁵.

Այնուամենայնիվ, շրջակա միջավայրում առկա սնկերը կարող են նաև վարակել մարդկանց, օրինակ.

• պատվաստման միջոցով, օրինակ ՝ վնասվածքի ժամանակ (որը հանգեցնում է սպորոտրիկոզի կամ քրոմոմիկոզի և այլն);
• բորբոսների ինհալացիա (հիստոպլազմոզ, ապերգիլոզ և այլն);
• վարակված անձի հետ շփման միջոցով (քենդիոզ, ռինգվուր և այլն);
• վարակված կենդանու հետ շփման միջոցով: