Փոքր երեխաների մոտ, հորմոնալ շեղումների դեպքում, բուժումը կարող է բաղկացած լինել ներարկումներից Testosterone, որի չափաքանակն ու կանոնավորությունը սահմանում է էնդոկրինոլոգը։ Այս լավ հետևված բուժումը մեծացնում է առնանդամի չափը: Երբ միկրոպենիսը առաջանում է առնանդամի հյուսվածքների կողմից, որոնք անզգայուն են տեստոստերոնի նկատմամբ, այս հորմոնալ բուժումը ոչ մի ազդեցություն չի ունենում:

Որքան շուտ հայտնաբերվի միկրոպենիսը, այնքան ավելի արագ կիրառվի բուժումը, այնքան ավելի արդյունավետ կլինի այն: Բուժումը կարող է անհրաժեշտ լինել նաև սեռական հասունացման շրջանում: Սեռական հասունացումից հետո հորմոնալ բուժումն այլևս արդյունավետ չէ, քանի որ հյուսվածքներն այլևս նույն կերպ չեն արձագանքում:

Միկրոպենիսի վիրաբուժական բուժում     

Հասուն տարիքում, երբ միկրոպենիսը չի բուժվել կամ երբ բուժումը բավականաչափ արդյունավետ չի եղել, վիրաբուժություն հնարավոր է. Այնուամենայնիվ, դա միշտ չէ, որ համոզիչ արդյունքներ է տալիս։

Կապանի հատվածը կասեցնող կարող է առաջարկվել առնանդամի, որը առնանդամից անցնում է պուբիս: Այն ոչ մի կերպ չի փոփոխում առնանդամը, այլ մասամբ անջատում է այն pubis-ից՝ երկարացնելով այն: Դիտարկված աճը 1-ից 2 սմ է թուլացած վիճակում և 1,7 սմ էրեկցիայում: Այս երկարացումը ձեռք է բերվում անկայուն էրեկցիա առնանդամի գնով, քանի որ այն ավելի քիչ լավ կպչում է pubis-ին, ինչը կարող է ավելի քիչ հեշտացնել ներթափանցումը:

THEավտոլոգային ճարպի ներարկում ներառում է սուբյեկտի ճարպի ներարկումը նրա առնանդամի մաշկի տակ: Սա ոչ մի կերպ չի երկարացնում առնանդամը, այլ տեսողականորեն այն ավելի հաստ է դարձնում։ Տեղադրված ճարպի միայն մի մասը ժամանակի ընթացքում չի ներծծվում օրգանիզմի կողմից (10-ից 50%՝ կախված թեմայից): Ռեզորբցիան ​​կարող է լինել անհավասար և հանգեցնել առնանդամի «տերողորմյա» տեսքի:

Միկրոպենիսը կարող է զգալի հոգեբանական հետևանքներ ունենալ հատկապես դեռահասության շրջանում, կարևոր է, որ մարդուն օգնեն և հաշվի առնվեն նրա կասկածները։