Un մանրէաբանական հետազոտություն կամ վերլուծություն թույլ է տալիս գտնել և նույնականացնել մանրէներ ներգրավված ա վարակում.

Կախված վարակի վայրից, հնարավոր են մի քանի վերլուծություններ.

• մանրէաբանական հետազոտություն մեզ կամ ECBU
• մանրէաբանական հետազոտություն stools (տես ցողունի մշակույթը)
• մանրէաբանական հետազոտություն արգանդի վզիկ-հեշտոցային սեկրեցներ կանանց մեջ
• մանրէաբանական հետազոտություն սերմնահեղուկ մարդկանց մեջ
• մանրէաբանական հետազոտություն բրոնխային սեկրեցիա կամ թուք
• մանրէաբանական հետազոտություն կոկորդի շվաբրեր
• մանրէաբանական հետազոտություն մաշկի վերքերը
• մանրէաբանական հետազոտություն ուղեղային հյուսվածք (տես գոտկային ծակոց)
• մանրէաբանական հետազոտություն արյուն (տես արյան մշակույթ)

Այս տեսակի հետազոտությունը համակարգված չի նշանակվում վարակի դեպքում: Ամենից հաճախ, բակտերիալ ծագման վարակի առջև կանգնած, բժիշկը հակաբիոտիկներ է նշանակում էմպիրիկ, այսինքն `« պատահական », ինչը բավարար է դեպքերի մեծամասնության համար:

Այնուամենայնիվ, մի քանի իրավիճակներ կարող են պահանջել նմուշ և մանրէաբանական ճշգրիտ վերլուծություն վերցնել.

• վարակ իմունային անբավարար անձի մոտ
• վարակ, որը չի բուժվում հակաբիոտիկներով (և, հետևաբար, հավանաբար դիմացկուն է առաջին տրված հակաբիոտիկներին)
• ներհիվանդանոցային վարակ (տեղի է ունենում հիվանդանոցում)
• պոտենցիալ լուրջ վարակ
• կոլեկտիվ սննդային թունավորում
• կասկած վարակի վիրուսային կամ բակտերիալ բնույթի վերաբերյալ (օրինակ ՝ անգինայի կամ ֆարինգիտի դեպքում)
• որոշ վարակների ախտորոշում, ինչպիսիք են տուբերկուլյոզը
• եւ այլն: